Nettoyer les prunes, les laver, les couper en deux et retirer le noyau. Laver le thym, le secouer pour l'essuyer et effeuiller les brins. Couper le chèvre-boîte en tranches. Hacher grossièrement les cerneaux de noix.
Répartir les prunes dans un plat à gratin, les recouvrir de chèvre-boîte, les arroser de miel et d'huile d'olive, puis les parsemer de thym, de noix et de sel. Enfourner dans un four préchauffé à 180 °C (chaleur tournante : 160 °C ; gaz : niveau 2-3) pendant 10 à 15 minutes.
Couper le pain en tranches et l'enfourner 5 minutes avant la fin de la cuisson. Sortir les prunes du four et les laisser refroidir un instant. Répartir 2 moitiés de prune et du chèvre-boîte sur chacune des 6 assiettes, assaisonner de poivre et servir avec le pain.